MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci M56 plasmid pcpM56

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018635	CA	3	6	38	43	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018635	A	7	7	97	103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018635	TCG	2	6	148	153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018635	AT	3	6	160	165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018635	A	7	7	201	207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018635	AAT	2	6	239	244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018635	A	6	6	253	258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018635	ATC	2	6	276	281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018635	TA	3	6	288	293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018635	T	7	7	1276	1282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018635	ACC	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018635	ACC	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018635	ACC	2	6	1340	1345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_018635	ACC	2	6	1362	1367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018635	TTC	2	6	1379	1384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018635	CTG	2	6	1438	1443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018635	TC	3	6	3309	3314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018635	T	6	6	3333	3338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018635	A	8	8	3352	3359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018635	AT	3	6	3372	3377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018635	TTAA	2	8	3378	3385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018635	TAATT	2	10	4223	4232	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018635	T	8	8	4231	4238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018635	AAT	2	6	6726	6731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018635	TG	4	8	6763	6770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018635	AAC	2	6	6831	6836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018635	TTTC	2	8	6852	6859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018635	TCT	2	6	6930	6935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018635	AGAA	2	8	6983	6990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018635	AGT	2	6	7082	7087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018635	GT	3	6	7086	7091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018635	AGC	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018635	TA	3	6	7128	7133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018635	CTAA	2	8	7137	7144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018635	AAT	2	6	7169	7174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018635	TCA	2	6	7193	7198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018635	TAT	2	6	7270	7275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018635	ACA	2	6	7371	7376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018635	AATCA	2	10	7413	7422	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018635	ACA	2	6	7443	7448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018635	ATT	2	6	7449	7454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018635	GAAA	2	8	7500	7507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018635	GAAAG	2	10	7529	7538	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.